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个人简介

学历、职历、获奖、科研经费与特邀报告

佐藤玄的照片

佐藤 玄SATO Hajime

东京大学 农学生命科学研究科 副教授

东京大学 农学生命科学研究科 应用生命工学专业 生物信息工学研究室

以计算化学(量子化学计算、分子动力学计算、机器学习)为核心,致力于阐明萜类等天然产物的生物合成机理,并开展酶的功能改造与设计。

联系方式:hsato[at]bi.a.u-tokyo.ac.jp(请将[at]替换为 @ 后发送) researchmap:researchmap.jp/hajimesato

Education

学历

  • 1987 出生于山梨县甲府市
  • 2006 山梨县立甲府南高中 理数科 毕业
  • 2011 东京理科大学 药学部 毕业
  • 2013 东京大学大学院 药学系研究科 硕士课程 修了
  • 2016 东京大学大学院 药学系研究科 博士课程 修了(药学博士) 导师:内山真伸 教授
Appointments

职历

Awards

获奖

  • 2023 日本化学信息协会《JAICI 奖》
  • 2022 日本药学会《奖励奖》
  • 2021 日本药学会 生药天然物部会 2021 年度《奖励研究》
Grants

主要科研经费

含资助金额与资助期限的完整列表刊载于研究成果页面。

Invited lectures

特邀报告

  • Aug 27, 2026 The University of Tokyo, Yayoi Campus, Seihoku Gallery Collaboration of experiment, informatics, and computational science in food and enzyme research (hosted by QunaSys Inc.)
    《Accelerating computational chemistry with AI》
  • Aug 11, 2026 IPMB Seminar, Academia Sinica, Taiwan 《AI-Accelerated Mechanistic investigation of Enzymatic Reactions》
  • 2025年12月15–20日 Pacifichem 2025(美国 夏威夷) Biosynthesis of Natural Products and Biomaterials (BIO009)
    《Mechanistic Investigation of Terpene Cyclases using Computational Chemistry and Artificial Intelligence》
  • 2025年8月29日 1st Japanese–Australasian Symposium on the Biosynthesis of Natural Products(澳大利亚 悉尼) 《AI-Assisted Computational Study of Terpene Cyclization Mechanism》
  • 2025年8月4–8日 TERPNET 2025(澳大利亚 布里斯班) 《AI-Assisted Prediction of Terpene Cyclization Mechanism》
  • 2025年6月4日 2025 年度 学术变革领域研究 A 数字有机合成青年研讨会(岩手大学) 《运用计算化学解析萜类环化酶》
  • 2024年12月9日 2024 年度 日本化学会关东支部讲演会(山梨大学) 《揭开分子的幕后 — 计算化学带来的新发现》
  • 2024年11月25日 先驱项目 2024 研讨会 新型化学模态连接的光生命科学基地(金泽大学) 《计算化学挑战萜类生物合成研究》
  • 2024年6月13日 横滨国立大学 特邀报告 《以计算化学为核心的分子设计与反应解析》
  • 2023年12月20日 日本药学会关东支部线上研讨会 《以理论计算为核心的天然产物生物合成机理研究》
  • 2023年10月19日 东京理科大学 药学部(野田校区) 《以理论计算为核心的天然产物生物合成研究》
  • 2023年10月13日 山梨县立甲府南高中 SSH 相关项目 《药学研究:从基础到前沿》
  • 2021年11月29日 GTR Chemistry Workshop 2021(名古屋大学 卓越研究生院项目) 《以理论计算为核心的天然产物生物合成研究》
  • 2020年1月29日 理化学研究所 CSRS 信息学与数据科学推进项目 成果报告会 《基于计算化学阐明萜类生物合成中结构多样性的产生机制》
  • 2018年10月9日 植物科学青年研究者会(千叶大学 植物分子科学研究中心) 《从计算化学与实验科学两方面研究赖氨酸来源生物碱的生物合成》
  • 2017年11月2日 东京大学 农学部 《Theoretical Studies on Terpene-Forming Carbocation Cyclization/Rearrangement Reactions》
Selected papers

代表性论文

1Enzymatic skeletal editing reaction forming the 1,3,5-triazine core during biosynthesis of the anticancer nucleoside analog 5-azacytidine

A. Umezawa†, T. Tsunoda†, Y. Nakashima†, Y.-L. Wang, T. Yoneda, C. Maruyama, N.-S. Hsu, T. Matsuyama, K. Miyamoto, H. Sato, A. Shimose, R. Takazawa, Y. Hamano, T.-L. Li, Y. Inokuma, M. Uchiyama, Y. Ogasawara*, H. Morita*, T. Dairi*

Nature Catalysis, 2026, accepted.

DOI: 10.1038/s41929-026-01611-x

2Formal Chemoenzymatic Skeletal Editing of Fusicoccane Core to Access 6-Aza-fusicoccanes

Seiya Endo, Eigo Fukuda, Ken-ya Hori, Kei-ichi Murai, Atsushi Nakayama, Yoko Yasuno, Masayoshi Arai, Hajime Sato, Tomohisa Kuzuyama, Tetsuro Shinada

JACS Au 2026, 6 (9), 5207–5213.

DOI: 10.1021/jacsau.6c00833

3<a id="2024JACS_Au">DFT Study on Retigerane-type Sesterterpenoid Biosynthesis: Initial Conformation of GFPP Regulates Biosynthetic Pathway, Ring-construction Order and Stereochemistry</a>

Yuichiro Watanabe, Takahiro Hashishin, Hajime Sato,* Taro Matsuyama, Masaya Nakajima, Jun-ichi Haruta, Masanobu Uchiyama*

JACS Au, 2024, 4, 3484–3491.

DOI: 10.1021/jacsau.4c00313

4Revision of Peniroquesine Biosynthetic Pathway by Retro-biosynthetic Theoretical Analysis: Ring Strain Controls the Unique Carbocation Rearrangement Cascade

Taro Matsuyama,† Ko Togashi,† Moe Nakano, Hajime Sato,* Masanobu Uchiyama*

JACS Au, 2023, 3, 1596-1603.

DOI: 10.1021/jacsau.3c00039

5Elucidation of Late-stage Biosynthesis of Phomoidride: Proposal of Cyclization Mechanism Affording Characteristic 9-Membered Ring of Fungal Dimeric Anhydride

Shintaro Yamamoto,# Taro Matsuyama,# Taro Ozaki,* Jyunya Takino, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama,* Atsushi Minami,* and Hideaki Oikawa

J. Am. Chem. Soc., 2022, 144, 20998-21004. (#: equall contribution)

DOI: 10.1021/jacs.2c09308

6Molecular and Computational Bases for Spirofuranone Formation in Setosusin Biosynthesis

Xingxing Wei, Taro Matsuyama, Hajime Sato,* Dexiu Yan, Pui Man Chan, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama,* and Yudai Matsuda*

J. Am. Chem. Soc., 2021, 143, 17708–17715.

DOI: 10.1021/jacs.1c08336

7DFT Study on the Biosynthesis of Verrucosane Diterpenoids and Mangicol Sesterterpenoids: Involvement of Secondary-carbocation-free Reaction Cascades

Hajime Sato,* Bi-Xiao Li, Taisei Takagi, Chao Wang, Kazunori Miyamoto, and Masanobu Uchiyama*

JACS Au, 2021, 1, 1231–1239.

DOI: 10.1021/jacsau.1c00178

8DFT Study of a Missing Piece in Brasilane-Type Structure Biosynthesis: An Unusual Skeletal Rearrangement

Hajime Sato,* Takahiro Hashishin, Junichiro Kanazawa, Kazunori Miyamoto and Masanobu Uchiyama*

J. Am. Chem. Soc., 2020, 142, 19830–19834.

DOI: 10.1021/jacs.0c09616

9Biosynthesis of Indole Diterpene Lolitrems: Radical‐Induced Cyclization of an Epoxyalcohol Affording a Characteristic Lolitremane Skeleton

Yulu Jiang, Taro Ozaki, Mei Harada, Tadachika Miyasaka, Hajime Sato, Kazunori Miyamoto, Junichiro Kanazawa, Chengwei Liu, Jun-ichi Maruyama, Masaatsu Adachi, Atsuo Nakazaki, Toshio Nishikawa, Masanobu Uchiyama, Atsushi Minami,* Hideaki Oikawa*

Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 17996–18002.

DOI: 10.1002/anie.202007280

10Functional Analysis of a Biosynthetic Gene Cluster Demonstrates Role of Spontaneous Double Bicyclo-ring Formation Including 8π–6π Electrocyclization in Shimalactone Biosynthesis

Isao Fujii,* M. H., K. K., A. U., H. S., K. S., H. T., M. I., S. Y., A. K., R. F., A. H., K. S., T. A., J. I., D. W., Y. G., A. Watanabe, M. Watanabe, Y. Masumoto, J. Kanazawa, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama*

Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 8464–8470.

DOI: 10.1002/anie.202001024

11Computational Studies on Biosynthetic Carbocation Rearrangements leading to Quiannulatene: Initial Conformation Regulates Biosynthetic Route, Stereochemistry, and Type of Skeleton.

Hajime Sato,* Takaaki Mitsuhashi, Mami Yamazaki, Ikuro Abe,* Masanobu Uchiyama*

Angew. Chem. Int. Ed., 2018, 57, 14752–14757.

DOI: 10.1002/anie.201807139

12Structural and Computational Basis for Dramatic Skeletal Rearrangement in Anditomin Biosynthesis.

Yu Nakashima, Takaaki Mitsuhashi, Yudai Mtsuda, Miki Senda, Hajime Sato, Mami Yamazaki, Masanobu Uchiyama,* Toshiya Senda,* Ikuro Abe*

J. Am. Chem. Soc., 2018, 140, 9743–9750.

DOI: 10.1021/jacs.8b06084